Expertsystem är beroende av en bra kunskapsbas och slutledningssystem; för vissa områden kan konsensuspositioner vara svårt att uppnå. Vissa områden är dessutom mycket beroende av sammanhang eller tyst kunskap.

Expertsystem kan bli för konservativa, de baseras ju på gradvist insamlade data. Eftersom uppdatering dessutom kostar mycket pengar och testning och marknadsföring av uppdateringen tar tid så kan de rent av vara gammalmodiga när de väl börjar användas.

Nu har inte området levt upp till sin potential. De måste utformas för att passa uppgiften, inte datavetenskapen eller teorin.